明萬歷年間，朝廷授命世代簪纓的慕容家組建一個處理江湖和廟堂之間事宜的組織，該組織廣納身懷絕技的武林高手，其中不乏少林、武當等豪門，又因為組織所在的衙門東、南、西三面各有兩扇門，共計六扇門，被人們稱為“六扇門”。 本片以少年越飛、呂青鋒、霍錦煙、陳思瑤四位少年成長和行俠仗義兩條主線交織糅合,講述了四位少年初長成,再入江湖,經歷了戰火的洗禮，明白了國家興亡、匹夫有責的道理，身為練武之人要為國為民出力，抵抗倭寇，四人正式加入六扇門，開始了自己的一段全新的生活。而江湖中的風波卻愈演愈烈，一場驚天動地的陰謀此時才緩緩展開，孩子們也要面臨更大的挑戰，但他們無所畏懼繼續并肩同行,最終成為一方少年英雄的故事。